化妆品中含有大量的营养成分和水，若有微生物则容易大量繁殖导致产品变质。消费者使用变质的产品容易引起皮肤过敏等安全问题。

化妆品直接驻留在皮肤上，因此化妆品原料的成分和使用量都有法规严格要求。例如防腐剂的使用量方面大多在法规都有明确的要求。防腐剂在产品中主要作用是抑制微生物生长，从而达到保障产品质量。若化妆品包装本身存在大量的微生物，即使加了防腐剂的产品都有很大可能导致产品变质，因此包材的消毒也是尤为重要。

化妆品分装瓶包材的消毒方法有以下几种：
1. 温开水反复冲洗法：准备温开水，用其反复冲洗分装瓶。冲洗次数约10-15次，再用吹风机开冷风以最大的风力吹干，让风度和水流速度营造出尽量无菌的旅行分装瓶内环境。
2. 酒精消毒法：对塑料或硅胶化妆品分装瓶，可以用酒精进行消毒。首先将分装瓶注满温水，滴入2滴洗洁精，摇匀。然后再倒入适量的酒精，再用力摇晃瓶子，待瓶子内液体变透明后倒掉。再用清水冲净。
3. 双氧水消毒法：双氧水可以用来对分装瓶进行消毒。首先按照1:1的比例将双氧水和清水兑在杯子中，然后用软海绵沾取混合液，对分装瓶外部进行擦拭，最后用清水冲洗干净即可。
4. 白醋消毒法：用白醋对分装瓶进行消毒时，要将分装瓶灌上八分满的清水，然后将它们一同放入洗碗池，再使用流动水冲洗5分钟。最后用干净抹布将水擦干即可。

随着生产技术越来越成熟，目前很多生产包材的生产厂家在产品上市前都会做产品消毒，化妆品厂家购买时可向包材供应商注明包材要求从而减少了大量的时间和生产成本。